一、按使用材料分類
根據箱子主體部件（側壁、端壁、箱頂等）采用什么材料，就叫做什么材料制造的集裝箱，按使用材料分類，集裝箱可分成三種：
（1）鋁合金集裝箱，優點是重量輕，外表美觀，防腐蝕，彈性好，加工方便以及加工費、修理費低，使用年限長；缺點是造價高，焊接性能差；
（2）鋼制集裝箱，優點是強度大，結構牢，焊接性高，水密性好，價格低廉；缺點是重量大、防腐性差；
（3）玻璃鋼制集裝箱，優點是強度大，剛性好，內容積大，隔熱、防腐、耐化學性好，易清掃，修理簡便；缺點是重量大，易老化，擰螺栓處強度降低。
二、按結構分類
按結構分類集裝箱可分為三類：
（1）內柱式（linterior post type container）與外柱式集裝箱（outsider post type container），主要指鋁合金集裝箱，內柱式集裝箱是指側柱（或端柱）位于倒壁或端壁之內；外柱式集裝箱是指側柱（或端柱）位于倒壁或端壁之外；
（2）折疊式集裝箱（collapside container），指集裝箱的主要部件（側壁、端壁和箱頂）能簡單地折疊或分解，再次使用時可以方便的再組合起來；
（2）薄殼式集裝箱（monocoque container），是把所有部件組成一個鋼體，它的優點是重量輕，可以適應所發生的扭力而不會引起******變形。
三、按使用目的分類
1、普通集裝箱
普通集裝箱，又稱干貨集裝箱（dry container）以裝運件雜貨為主，通常用來裝運文化用品、日用百貨、醫藥、紡織品、工藝品、化工制品、五金交電、電子機械、儀器及機器零件等。這種集裝箱占集裝箱總數的70 ~ 80%。除了冷凍貨、活的動物、植物之外，在尺寸、重量等方面適合集裝箱運輸的貨物，均可使用干貨集裝箱。
2、冷凍集裝箱
冷凍集裝箱（reefer container）分外置和內置式兩種。溫度可在-60℃ ~ +30℃之間調整。內置式集裝箱在運輸過程中可隨意啟動冷凍機，使集裝箱保持指定溫度；而外置式則必須依靠集裝箱專用車、船和專用堆場、車站上配備的冷凍機來制冷。這種箱子適合在夏天運輸黃油、巧克力、冷凍魚肉、煉乳、人造奶油等物品。
3、開頂集裝箱
開頂集裝箱,又稱敞頂集裝箱、開頂柜（open top container），這種集裝箱沒有箱頂，但有可折式頂梁支撐的帆布、塑料布或涂塑布制成的頂篷，可用起重機從箱頂上面裝卸貨物，開頂箱頂部可開啟或無固定項面的集裝箱，裝運時用防水布覆蓋頂部，其水密要求和干貨箱一樣。適合于裝載玻璃板、鋼制品、機械等重貨。
4、框架集裝箱
框架集裝箱（flat rack container）沒有箱頂和兩側，其特點是從集裝箱側面進行裝卸。以超重貨物為主要運載對象，還便于裝載牲畜，以及諸如鋼材之類可以免除外包裝的裸裝貨。還可以便于大型超寬，超高貨物的吊裝。
5、牲畜集裝箱
牲畜集裝箱（pen container）這種箱子側面采用金屬網，通風條件良好，而且便于喂食。是專為裝運牛、馬等活動物而制造的特殊集裝箱。
6、罐式集裝箱
罐式集裝箱（tank container）又稱液體集裝箱。是為運輸食品、藥品、化工品等液體貨物而制造的特殊集裝箱。其結構是在一個金屬框架內固定上一個液罐。國際標準罐是一種安裝于緊固外部框架內的不銹鋼壓力容器。罐體內膽大多采用316不銹鋼制造。多數罐箱有蒸氣或電加熱裝置，惰性氣體保護裝置，減壓裝置及其它流體運輸及裝卸所需的可選設備。
7、平臺集裝箱
平臺集裝箱（platform container）形狀類似鐵路平板車，是具有高承載能力的底板而且沒有上部結構的集裝箱。適宜裝超重超長貨物，長度可達6米以上，寬4米以上，高4.5米左右，重量可達40公噸。且兩臺平臺集裝箱可以聯結起來，裝80公噸的貨，用這種箱子裝運汽車極為方便。
8、通風集裝箱
通風集裝箱（ventilated container）箱壁設有4-6個通風孔，內壁涂塑料層，適宜裝新鮮蔬菜和水果等怕熱怕悶的貨物。
9、保溫集裝箱
保溫集裝箱（insulated container）箱內有隔熱層，箱頂又有能調節角度的進出風口，可利用外界空氣和風向來調節箱內溫度，緊閉時能在一定時間內不受外界氣溫影響。適宜裝運對溫濕度敏感的貨物。
10、散裝貨集裝箱
散裝貨集裝箱（bulk container）一般在頂部設有2~3個小艙口，以便裝貨。底部有升降架，可升高成40°的傾斜角，以便卸貨。這種箱子適宜裝糧食、水泥等散貨。如要進行植物檢疫，還可在箱內熏艙蒸洗。
11、散裝粉狀貨集裝箱
散裝粉狀貨集裝箱（freeflowing bulk material container）與散裝箱基本相同，但裝卸時使用噴管和吸管。
12、掛式集裝箱
掛式集裝箱（dress hanger container）適合于裝運服裝類商品的集裝箱。隨著國際貿易的發展，商品結構不斷變化，今后還會出現各種不同類型的專用或多用集裝箱。
